O ozônio é frequentemente usado no tratamento de água potável, de água de processo e de efluentes, para desinfecção nos processos de lavagem (lavagem de frutas, legumes, verduras e frutos do mar), desinfecção de piscinas, desinfecção de sistemas de lavagem de garrafas, remoção de ferro e manganês, melhoria de gosto e odor, eliminação de limo em depósitos e tubos, trocadores de calor, conexões, branqueamento de polpa de celulose, degradação de pesticidas, hidroponia, sanitização de superfícies, etc.

No ar, oozônio pode ser utilizado para remoção de odores e como barreira sanitária no isolamento de epidemias transmitidas pelo ar, confinamento de animais, desinfecção de sistemas de ar condicionado de hospitais e locais públicos. Também pode ser aplicado no ar para redução de carga microbiológica (fungos, vírus e bactérias) e em câmaras frias de estocagem de alimentos (queijos, salames, maçãs).

Alguns estudos mostram, ainda, a aplicação do ozônio na área médica, para tratamento de diabetes, câncer e herpes, além da odontologia, para tratamento de canais e desinfecção bucal. A geração de óleos ozonizados e aplicação cosmética também são outras utilidades do ozônio.